Desde 1997 hasta hoy, la iniciativa del CMAR ha evolucionado en distintas etapas. La propuesta original sólo incluía Cocos-Galápagos, a lo que se llamó “Corredor Biológico Marino: Galápagos – Isla del Coco”.
Posteriormente, se creó el “Triángulo Insular Marino: Galápagos – Cocos – Malpelo”, con base en criterios de expertos sobre la necesidad de agrupar varias Áreas Marinas Protegidas que tienen un origen común de ser Islas Oceánicas.
En el marco del Foro Mundial de Ministros de Ambiente de la Organización de las Naciones Unidas, realizada en Cartagena, Colombia, en Febrero de 2002, la propuesta se amplió al incluir las islas continentales de Gorgona y Coiba.
El 2 de abril del 2004 en la ciudad de San José, Costa Rica, representantes de Alto Nivel de los Ministerios de Ambiente de los países miembros, suscribieron una Declaración Conjunta mediante la cual reiteraron el compromiso expresado durante la Cumbre de Desarrollo Sostenible y acuerdaron establecer el Corredor Marino del Pacífico Este Tropical entre las Islas de Galápagos, Coco, Malpelo, Gorgona y Coiba, (CMAR), como un instrumento eficaz para la conservación y uso sostenible de la biodiversidad de la región del Pacífico Este Tropical, además de establecer un marco regional adecuado que facilite el desarrollo y la gestión integral compatible con las políticas y legislaciones de los cuatro países miembros de la Iniciativa.